新海南客戶端、南海網(wǎng)、南國都市報11月3日消息(記者 王燕珍)2022年10月28日,國際基因工程大賽在法國巴黎圓滿結(jié)束,海南大學(xué)HainanU-China代表隊斬獲金獎。這是一支由24名在校學(xué)生自發(fā)組織參加iGEM的團隊,他們一路克服各種難題,最終憑借項目“核酸追蹤者:一種便攜式、單堿基、無擴增,基于CRISPR/Cas的核酸檢測平臺”斬獲金獎。
海大HainanU-China 團隊在iGEM奪金。所有圖片由海南大學(xué)提供
24名在校學(xué)生組成團隊 憑項目“核酸追蹤者”在國際大賽中奪金
10月28日,2022年國際基因工程機器大賽(International Genetically Engineered Machine Competition, 簡稱iGEM)在法國巴黎舉行。作為海南大學(xué)首次參與該賽事的團隊,海南大學(xué)代表隊(HainanU_China)在南海海洋資源利用國家重點實驗室等相關(guān)單位部門的大力支持下,與來自麻省理工學(xué)院、哈佛大學(xué)、清華大學(xué)、北京大學(xué)等高校的350支代表隊同場競技,憑借項目“核酸追蹤者:一種便攜式、單堿基、無擴增,基于CRISPR/Cas的核酸檢測平臺”斬獲金獎,實現(xiàn)了該校在國際基因工程機器大賽零的突破。
HainanU_China隊徽。
據(jù)介紹,該團隊基于CRISPR/Cas13a&14a與Csm6蛋白,并加入PNA以減少脫靶率,開發(fā)了一套核酸檢測平臺,將其應(yīng)用于海洋微生物耐藥性的便攜、快速、精準檢測中。該方案相比于傳統(tǒng)基于ELISA、RT-PCR、分子診斷的微生物檢測方法具有效率高、成本低、特異性強的特點,降低了對大型檢測設(shè)備與專業(yè)人員的要求。通過實驗以及理論分析,利用多種非相關(guān)性酶的串聯(lián),該團隊證明了此設(shè)計的可行性。
原來,2022年海南大學(xué)iGEM團隊由來自于熱帶作物學(xué)院、生命科學(xué)學(xué)院、外國語學(xué)院、網(wǎng)絡(luò)空間安全學(xué)院、化學(xué)工程與技術(shù)學(xué)院、計算機科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、美術(shù)與設(shè)計學(xué)院、信息通信與工程學(xué)院、海洋學(xué)院、國際旅游學(xué)院、南海海洋資源利用國家重點實驗室共計24名在校學(xué)生組成,并依托海南大學(xué)萬逸研究員課題組實驗平臺開展項目。
團隊部分成員合影。
記者從海南大學(xué)了解到,HainanU-China作為海南大學(xué)第一支由學(xué)生自發(fā)組織參加iGEM的團隊,在沒有前人經(jīng)驗的情況下,不斷摸索、總結(jié)經(jīng)驗、完善項目。疫情反復(fù),2022年海大iGEM隊頂住壓力,從前期的隊員選拔、頭腦風(fēng)暴、課題選定、干實驗?zāi)M和濕實驗進行、經(jīng)費管理、實驗操作、聯(lián)系行業(yè)專家、校際合作,再到中國區(qū)CCIC iGEMer交流大會、Wiki展示網(wǎng)站搭建、總決賽路演答辯,取得了開創(chuàng)性佳績。這全方位鍛煉了本校學(xué)生的科研能力、創(chuàng)新思維、團隊協(xié)作能力和合作能力等綜合素質(zhì),培養(yǎng)了堅持不懈、艱苦奮斗的精神。
據(jù)了解,國際基因工程機器大賽是由美國麻省理工學(xué)院(MIT)于2003年創(chuàng)辦,現(xiàn)已發(fā)展成為合成生物學(xué)領(lǐng)域的國際頂級大學(xué)生科技賽事,也是涉及數(shù)學(xué)、計算機、統(tǒng)計學(xué)等領(lǐng)域交叉合作的跨學(xué)科競賽。國際基因工程機器大賽賽況和研究成果每年都受到《Science》《Nature》等學(xué)術(shù)雜志的關(guān)注,具有廣泛的國際影響力。
研究過程不斷克服各種難題 賽前模擬數(shù)次答辯環(huán)節(jié)
“其實從組隊到研究、準備答辯環(huán)節(jié)等,我們都遇到了多次難題。”據(jù)海南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院學(xué)生黃碩介紹,2022年3月,在海南大學(xué)周海龍老師的召集和李天行同學(xué)的協(xié)助下,初步了解了iGEM大賽后,當時正在大二就讀的他和正在大三在讀的該校熱帶作物學(xué)院學(xué)生唐榕鍇一拍即合,作為該團隊的學(xué)生隊長,他們在學(xué)校開始征集團隊成員,成員是該校大一到大四的學(xué)生,該團隊主要分為三個大組:實驗組、人類實踐組、美工和網(wǎng)站組。
記者了解到,此前黃碩就曾參加了國內(nèi)高校的各類生命科學(xué)主題競賽和計算機大賽,還獲得過全國二等獎、省級一等獎等多個獎項,唐榕鍇則是國家級大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計劃項目的負責(zé)人,兩人都具有豐富的參賽經(jīng)驗和極強的組織能力。
不過,光是團隊成員的確立,也是一波三折,期間有成員因承受不住各種壓力中途退出,該團隊只能開展第二輪招生,原本應(yīng)該在3月要完成搭建的網(wǎng)站,直到8月才完成。
實驗設(shè)計圖。
據(jù)黃碩介紹,海南是海洋大省,他們一開始就想從海洋入手。據(jù)他們了解,目前國內(nèi)外控制水產(chǎn)養(yǎng)殖動物細菌性疾病的主要手段是使用抗菌藥物,但抗生素的大規(guī)模使用會帶來微生物耐藥性問題。在這種背景之下,以本課題組為基礎(chǔ),將其應(yīng)用于海洋病原微生物及其耐藥性的檢測,有利于水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)對不同病原菌的早期發(fā)現(xiàn)和治療,也有利于頑固耐藥菌的治療。同時,該技術(shù)可應(yīng)用于各行業(yè)、不同生物體、不同癥狀的核酸檢測。也就是說,只需要進行核酸檢測,該系統(tǒng)就能實現(xiàn)靶向檢測。為此,他們也對受眾群體水產(chǎn)養(yǎng)殖戶開展了問卷調(diào)查,同時針對項目前景也咨詢了該校老師,很快確定了該課題。
HainanU_China線下組會。
因團隊成員白天要上課,大家只能利用業(yè)余時間去開展課題研究和討論,熬夜更是家常便飯。每周該團隊都會有線上線下的會議,如果是線下的,需要提前借教室。本來要和合作高校開展合作,但是因疫情原因又取消了。
團隊的項目獲得第9屆CCiC最佳硬件設(shè)計。
值得一提的是,該團隊在8月18日到22日在線參加了第九屆中國區(qū)域iGEM交流會,來自中國不同團隊的iGEM人齊聚一堂,海南大學(xué)HainanU-China代表隊從眾多團隊中脫穎而出,獲得了最佳硬件設(shè)計獎。“我們在演講中,簡要匯報了我們項目的設(shè)計和進展情況,評委們?yōu)槲覀兲峁┝酥匾姆答仭a槍@些反饋,通過研究更好地定義了該團隊的項目應(yīng)用場景,以便團隊可以進一步修改最終產(chǎn)品。”黃碩說。
HainanU_China網(wǎng)站首頁。
“雖然有種種波折,但是我們團隊都沒放棄該課題,大家一直在線上進行溝通如何解決問題、討論下一步具體工作,有一次開會討論甚至開到凌晨四點才結(jié)束。我們的網(wǎng)站版頭經(jīng)過多少次的修改,我也記不清楚了。”黃碩回憶道,在海南大學(xué)王步華老師的幫助下,該團隊每三天開一次實驗相關(guān)課題會,老師還帶著他們團隊攻克了一些技術(shù)難題。直到9月份,該課題取得明顯進展,證明了該實驗技術(shù)的可行、可用性。
海大HainanU-China 團隊在iGEM奪金。
“因為疫情防控原因,今年我們都是通過線上參賽。在此前做準備時,我們還邀請了海南大學(xué)等多個學(xué)校的資深老師在線上幫助我們模擬了數(shù)次答辯環(huán)節(jié),老師指出了我們的不足,我們也不斷修改所準備的內(nèi)容。”黃碩告訴記者,因做了充足準備,在15分鐘的“路演”中,每一次評委提出問題時,團隊成員應(yīng)對迅速、回答充分,給評委留下深刻印象。
黃碩說,10月28日,當團隊得知獲獎的消息,都十分激動、開心,大家還在群里復(fù)盤了此次的參賽過程,總結(jié)了不足和積累的經(jīng)驗,“這次比賽給了我們學(xué)生一個學(xué)習(xí)和鍛煉的機會,期間我們得到了海南大學(xué)陳銀華老師等多位老師的指導(dǎo)和幫助,我們也學(xué)到許多專業(yè)知識,和各個高校的學(xué)生進行了更多交流開闊了視野,收獲很多,也更豐富了我們的履歷。”
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